Одним из её направлений стала военная реформа. В сентябре сорок пятого были упразднены Государственный комитет обороны и Ставка Верховного Главнокомандования. Накануне ноябрьских праздников 1945 года Наркомат обороны Наркомат Военно-Морского Флота объединили в единое Министерство обороны и появилось название Советская Армия. Его первым руководителем стал товарищ Сталин.
Во временном разброде и шатании в американской авиации и сбое атомной программы после тинианской катастрофы товарищ Сталин увидел шанс уменьшить отставание Советского Союза в военной сфере в целом и особенно в этих областях.
Появление реактивной авиации, ракетной техники и ядерного оружия уже свершившийся факт и он требовал изменения всей структуры войск. Поэтому перед седьмым ноября сорок пятого было не только переименование нашей армии и создание Министерства обороны.
В этот же день официально появились советские Сухопутные войска, Главнокомандующим которых стал маршал Жуков, Войска ПВО страны как самостоятельный род войск, командующим которых был назначен маршал Говоров, и было принято решение о формировании 72-ой инженерной бригады особого назначения в составе Группы советских войск в Германии.
То, что на Запад сумел уйти только Вернер фон Браун, а почти все его сотрудники, а самое главное вся самая ценная техническая информация о ракетной программе третьего рейха оказалась в распоряжении Советского Союза. Созданный осенью 1945 года в городе Нордхайзене в окрестностях Эрфурта секретный советский ракетный институт на основе немецкой Фау-2 начал работы по созданию советских баллистических ракет, которому была придана специальная воинская часть, сформированная 72-ая инженерная бригада особого назначения в составе Группы советских войск в Германии. А в мае 1946 года появился полигон Капустин Яр.
Проблемы в советской военной авиации и недостатки в её руководстве остро проявившиеся сразу же после окончания войны, были объективной реальностью и «авиационное дело» просто не могло не возникнуть.
Но никакого «трофейного» дела не было, как и компании по компрометации маршала Жукова. Поэтому результатами разбора положения дел в отечественное военной авиации оказались не тюремные сроки, а административные и партийные меры. Командующий ВВС маршал Новиков был снят с занимаемой должности и понижен в звании, а нарком Шахурин в итоге стал не министром авиационной промышленности, а одним из заместителей своего сменщика Михаила Васильевича Хруничева. Маршал авиации Худяков вообще не привлекался в ответственности по этому делу, так как не было пропажи в 1945 году пропажи «золотого» самолета бывшего императора Маньчжоу-Го Пу И.